L'estomac est la seconde étape de la digestion, juste après la mastication. Il assure l'essentiel de la digestion des protéines et dans une moindre mesure, des glucides et des lipides par le sécrétion d'acide chlorhydrique et d'une palette d'enzymes comme la pepsine ou la lipase. Cette phase de dégradation est indispensable à la bonne assimilation ultérieure des nutriments.

L'estomac contient 1,5 litre d'acide chlorhydrique concentré, de quoi maintenir un pH acide (entre 1,5 pendant la nuit et 5 en début de digestion). Cette acidité a une utilité physiologique : bien digérer les aliments et un grand nombre de bactéries et de virus avant qu'ils n'atteignent l'intestin. Les antiacides doivent donc être envisagés uniquement en cas de problème avéré.

A l'action chimique s'ajoute une action mécanique de malaxage sous l'effet des contractions de l'estomac, qui dispose de trois couches de muscles lisses. L'intérieur de l'estomac, d'une contenance d'un à un litre et demi, est recouvert d'une muqueuse et d'un mucus résistants aux sucs gastriques. Le bol alimentaire - ou chyme - met entre deux et trois heures pour passer dans l'intestins grêle, selon ce que l'on a mangé. Sauf quand l'estomac est contrarié...

Entre 20 et 40% de la population française se dit concerné par le reflux gastro-œsophagien (RGO). Le RGO désigne la remonté d'une partie du contenu de l'estomac dans l'œsophage. Or, si l'estomac est équipé pour résister aux sucs gastrique acides, ce n'est pas le cas de l'œsophage, qui manifeste des sensations d'irritation et de brûlures. Ce sont elles qu'on désigne par "brûlures d'estomac".

Cette remontée résulte d'un défaut d'étanchéité du sphincter oesophagien inférieur (SOI), une zone musculaire située à la jonction de l'œsophage et de l'estomac. Dans cette zone règne une pression supérieure à celle de l'œsophage et de l'estomac. C'est l'onde de contraction œsophagienne poussant le bol alimentaire vers l'estomac qui abaisse cette pression et permet au sphincter de livrer passage. Les mécanismes qui régissent ce sphincter ne sont pas totalement éclaircis, mais sont fonctionnement requiert la présence d'un segment d'œsophage dans l'abdomen, ainsi qu'un certain angle que fait la partie haute de l'estomac.

Il arrive que ces deux particularismes soient dérangés (remontée du segment abdominal de l'œsophage dans le thorax), notamment par une pression excessive dans l'estomac, précipitant l'effondrement de la pression du SOI et donc la survenue d'un RGO.

Souvent les signes du RGO sont limités à une gêne occasionnelle et supportable; brûlure au creux de l'estomac, remontées acides voire régurgitations. Mais si le phénomène persiste, il peut s'ensuivre de lésions graves, de l'œsophage comme de l'estomac.

La gastroparésie est un trouble chronique caractérisé par un ralentissement de la vidange de l'estomac  Il  es résulte une stagnation des aliments, entraînant des douleurs abdominales quotidiennes dans 90% des cas. Entre 2 et 4 % de la population serait concernée, donc 30 à 50% des diabétiques. Il importe de réduire le volume des repas et d'éviter les associations alimentaires difficiles à digérer. Prendre du gingembre une dizaine de minutes avant le repas tonifiera l'estomac.